Przed wybudowaniem Kościoła Bańska Niżna należała do parafii w Szaflarach. Inicjatorami budowy kościoła w Bańskiej Niżnej byli bracia Andrzej i Józef Bafiowie, wybudowali najpierw murowaną owczarnię, gdyż władze nie chciały dać zezwolenia na budowę kaplicy. W tym budynku przez jakiś czas uprawiali pieczarki, zanim przystosowano go do odprawiania majówek i sporadycznych mszy świętych odprawianych przez księży z Szaflar. Po zalegalizowaniu kaplicy Bańska Niżna uzyskała pierwszego księdza ks. Marka Spólnika, z którym parafianie w latach 1986-1994 ogromnym wkładem własnej pracy i pieniędzy zbudowali nowy kościół, a kaplicę całkowicie rozebrano.
